生理性抑郁临床上称为生物源性抑郁、重症抑郁、内源性抑郁，指大脑中有神经递质改变抑郁。大脑中有情绪调节有关的神经递质，比如5-羟色胺、去甲肾上腺素、多巴胺等，当大脑中的5-羟色胺的浓度下降时便会有抑郁的发生，称之为内源性抑郁或生物源性抑郁。

因此当患者患有生物性的抑郁时意味着大脑中有神经递质的失平衡，因此也需要用抗抑郁剂治疗。抗抑郁剂可以使失去平衡的神经递质恢复平衡，从而达到治疗抑郁症的目的。