垂体瘤手术的并发症主要有术后鞍内血肿、鼻衄，而鼻衄就是鼻腔的小动脉出血、黏膜溃烂出血或假性动脉瘤破裂出血。此外，还包括脑脊液鼻漏、脑膜炎、垂体功能低下、尿崩症、水电解质紊乱、眼肌麻痹、鼻中隔穿孔等并发症。

其中垂体功能低下和尿崩症是由于垂体前叶、后叶及垂体柄损伤导致。如果术中正常，垂体前叶、后叶及垂体柄保护良好，这种并发症往往呈一过性。

如果肿瘤巨大，切除肿瘤过程当中，垂体前叶、后叶及垂体柄损伤严重，术后垂体功能低下及尿崩症可能要持续很长一段时间，需要相应的药物治疗。如果术中或术后处理及时，其他的并发症大部分都可以恢复。