儿童化脓性扁桃体炎中西医结合的治疗效果更好，西医应用抗生素抗细菌感染，中医可辨证后以中药和中医外治法治疗。如果明确是化脓性扁桃体炎，血象和CRP很高，则考虑为链球菌感染，一般输注青霉素或头孢类抗生素可以起到很好的杀菌作用。如果不及时治疗，容易并发鼻窦炎、中耳炎和淋巴结炎等。如果为链球菌感染，应注意检查尿常规，以便及时发现并发的肾脏损害。治疗效果不佳时应注意是否有支原体感染，及早换药，或在开始时检查是否有支原体感染和病毒感染。
中药方面，在急性期以清热泻火、解毒消肿为主要疗法，可以用银翘散加减方，有金银花、连翘、马勃、板蓝根、射干、元参、地丁、青黛等，要根据具体的辨证表里虚实和伴发症状进行加减。同时可以应用中医外治法，有穴位贴敷、针灸、推拿等辅助治疗。
