胃肠道间质瘤是目前可应用靶向治疗，效果较好。胃肠道间质瘤经过切除标本或胃镜取活检的基因检测后，可出现名为CD117的指标，该指标阳性或该靶点可以应用靶向药物时，说明患者应用靶向药物治疗可以取得相对比较好的效果，即患者对靶向药敏感。所以基因检测的方法对于指导间质瘤的靶向药物治疗非常重要。

基因检测时看到每个基因的靶点，尤其是第9、第11外显子阳性时，首先预示患者复发转移风险相对较大，另外根据基因检测结果，医生可有更多的靶向药进行选择，如CD117阳性时，可以应用伊马替尼等靶向药物治疗。