宫外孕手术后头痛(头疼)的主要原因如下：

1、麻醉：宫外孕手术需在麻醉下进行，有可能是全麻，也有可能是腰麻。由于麻醉过程中需使用麻醉药，且腰麻还要进行腰椎间隙穿刺，术后部分患者会有头痛的感觉，但多数随着麻醉药代谢，术后第一天就可缓解；

2、术前贫血：部分患者由于术前就存在失血性休克、严重贫血，可能术后起床时会感觉头晕、头痛，经过补铁、补血以及逐渐调理后，能慢慢恢复；
3、腰椎穿刺失败：术后可以静卧平躺并补液，经过三天以后，多数能够恢复。

所以术后还是需要观察病情变化，如血压、脉搏、血常规的情况，根据具体情况对应处理，头痛多数能够缓解。