直肠子宫内膜异位症属于深部子宫内膜异位症，深部子宫内膜异位症是子宫内膜异位症的病理改变已经侵犯到腹膜以下、以外的脏器。如果异位的内膜只是出现在阴道直肠间隔或者直肠浆膜，甚至到达直肠浆肌层，在这种情况下做肠镜没有明显发现。因为如果没有穿透直肠黏膜层，通过肠镜无法观察到病变，如果要直观看到病灶，只能通过腹腔镜等方式观察。
在比较严重的情况下，如直肠子宫内膜异位症的病灶直接穿透直肠黏膜层，在肠镜下也可以看到病变。
因此如果是有子宫内膜异位症病史的患者，存在直肠、肛门异常出血的情况，可以做肠镜进一步排除是否发展到直肠黏膜层被穿透的可能。
