房颤是心脏系统疾病，可对心脏产生一定影响。首先由于房颤会造成心脏节律性、规律性跳动异常，长时间持续会加重心脏收缩的负担，长期则可引起心脏形状、结构发生变化，严重影响心脏功能。

此外房颤发作时可导致心房有效收缩减少，心脏摄血量降低，可导致心房中血液淤滞，从而启动血液凝血机制，可形成极不稳定血栓。血栓容易脱落，随血液运行至全身各处，最常见为进入脑部，形成缺血性中风。