绝大部分人脊髓栓系综合征影响主要是下半身问题，首先影响最多是大小便问题，尤其是小便。很多脊髓栓系病人对于小便控制能力比较差，经常漏尿、尿频、尿急等，读书时候小便不知不觉解出来或者经常要上厕所。有人会表现为大便污裤，即自己不知道裤子上有大便。有人会表现为便秘情况，即大便拉不出来或者大便比较干燥等。

还有下肢功能影响，有人会有马蹄内翻足或者下肢活动有一定障碍，比如脚跟有时候不着地。也有病人会有腰酸背痛影响，因为脊髓牵拉之后对于神经根刺激导致腰酸背痛。部分患儿可能经过手术治疗，可能还会存在大小便障碍、下肢功能障碍等后遗症。