强直性脊柱炎最常见症状是腰背部酸胀或疼痛，伴有晨僵，腰痛的特点是发病年龄比较年轻，患者多数为小于40岁起病，且起病比较隐匿，与腰椎间盘突出引起来的机械性疼痛不同，腰痛在活动后会有好转，而在休息时多有加重，夜间疼痛比白天更为明显。炎性腰背痛的患者对于非甾体类抗炎药的治疗效果较好。

此外，患者还可出现交替性臀部疼痛、足跟痛的表现。部分患者因关节外表现来就诊，包括眼睛受累，比如葡萄膜炎、虹膜睫状体炎。还可以出现其脏器受累，包括心脏受累，心脏瓣膜病变，肾脏受累较常见的是IgA肾病，肺部受累可以出现肺上部纤维化，可以出现相应临床症状。