阴茎上长了好多小水疱可能是阴茎单纯疱疹病毒感染或者湿疹，如下所示：
1、阴茎单纯疱疹病毒感染：最常见，病人发生阴茎单纯疱疹病毒感染时会形成多发水疱的症状，水疱破裂后会形成局部溃疡和局部疼痛症状。阴茎上长了好多小水疱需要规范的治疗，当病人出现水疱伴有疼痛症状时常常提示有单纯疱疹病毒感染，需要局部涂抹阿昔洛韦软膏，同时口服阿昔洛韦片治疗；
2、湿疹：阴茎上长了好多小水疱还见于阴囊湿疹或阴茎湿疹的病人，病人发生阴茎湿疹时会在阴茎皮肤表面形成集簇样水疱改变，局部皮肤增厚，伴有局部糜烂和局部瘙痒症状。阴茎上出现湿疹症状时可以用艾洛松软膏(糠酸莫米松乳膏)局部涂抹，该药对阴茎湿疹引起的集簇样水疱和瘙痒症状有较好的治疗效果。
