会厌囊肿一般情况不会自行消失，会厌囊肿是一种常见的咽喉部良性疾病，患者常表现为咽部异物感，有时没有任何症状，在进行喉镜检查时，发现会厌周围存在表面光滑的半圆形新生物，可单发或多发，可能是囊液的存积，不会引起特别明显的症状。如果会厌囊肿较大，可能会引起咽喉部异物感。

目前会厌囊肿具体的形成原因和发病机理不清，部分理论认为会厌囊肿的形成，与局部炎症刺激有一定关系。会厌囊肿患者可以适当进行药物治疗，减轻咽喉部炎症反应，局部异物感消失，难以将会厌囊肿去除。