有很多原因可以导致智力低下，如较多的遗传代谢性疾病、神经系统遗传疾病都可能会导致智力低下，这种患儿明确存在遗传因素，因为患儿携带相关基因，通常遗传的可能性非常大。

虽然目前无法明确诊断智力低下的患儿存在何种遗传代谢性疾病，也没有找到相关致病基因，同时患者家族中也没有类似的情况，但最近几年随着基因检测技术的提高，越来越多在过去认为没有病因的智力低下，现在确认的确存在遗传基因方面的问题。