肾盂肾炎临床分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎，以急性肾盂肾炎更常见。急性肾盂肾炎属于上尿路感染，80%感染细菌为大肠杆菌，最开始患者可能出现膀胱炎症状，细菌顺着输尿管到肾盂位置变成肾盂肾炎。肾盂血供较丰富，细菌较容易入血，易继发菌血症。其临床表现有尿频、尿急、尿痛、尿路刺激症状，同时可伴有发热、腰痛等全身症状，检查炎症指标可能较高。
急性肾盂肾炎尿培养通常以大肠杆菌多见，部分患者可出现血培养阳性，治疗疗程通常为2周，也可达到3周。通常多数患者经过规律治疗后均有效，即可完全治愈。治疗不彻底即可迁延变成慢性肾盂肾炎，有可能影响肾功能，如果治疗再迁延下去，也可能出现慢性肾功能不全。
