精神分裂症的治疗，目前在临床上主要是对症治疗，即针对疾病症状进行治疗，而不是对因治疗。因为病因太复杂，是由复杂机制导致的一类疾病。故对于治疗而言，也是尽可能临床治愈的水平。临床治愈是指控制症状、预防复发、保持患者的社会功能。精神分裂症的预后，主要有三个，第一类是一部分患者可达到临床治愈的水平，其疾病症状可得到完全缓解。第二类是能取得部分缓解，即一部分症状被控制，另一部分症状可能还有残留。如社会功能会出现一定的缺损，有的患者不能从事原来水平的工作，只能从复杂的工作岗位调整到简单的工作岗位。有的人甚至上不了班。第三类患者是虽然经过治疗，但是疾病恶化了，最终导致精神残疾。后两种可能占到全部患者的80%左右，即大部分人会有残留症状。所以精神分裂症的早期治疗、全病程治疗对预后有着比较关键的作用。
故本病应尽早开展系统治疗，其对保持患者的社会功能有一定帮助。其次，预后还和其他某些因素有关，如急性起病，病程短的患者，预后会相对良好。而情绪症状突出的患者比情感反应平淡的患者，预后相对好。另外，越早起病，年龄小的患者，可能对预后影响更大。此外，如果在起病的时候，人格相对保持完整，患者的状态可能会相对较好。有家庭和社会支持的患者，预后也相对较好。从疾病分型的角度上而言，单纯性精神分裂症的预后要比其它的分型较差，这是临床普遍认同的对预后有一定影响的因素。