肛周脓肿也可以分为多个阶段，也分为多种种类。有的是皮下脓肿，皮下脓肿可以通过外用的药物，比如黑豆油膏、清热解毒的中药外敷，结合简单的换药处理，穿刺抽脓以后，脓肿暂时得到缓解，也可能脓肿以后也不再发作。其实浅表的脓肿，通过保守的治疗方法可以治愈。
肛周脓肿需要进行切开引流，肛周脓肿的病人有红、肿、热、痛，一般走路、行动都受影响，有的人会表现有体温改变，这时候主要的治疗方法是排脓。要找到脓点，注射器进行消毒，进行穿刺抽脓，这种方法可以是诊断的手段，也能减轻脓肿的症状。有一部分脓肿，通过穿刺以后可以愈合，脓肿大部分还是要通过手术治疗，在手术下采取肛周脓肿的一次根治术。