大部分三叉神经痛都可以根治，但临床存在个别顽固性三叉神经痛治疗较为困难，会影响治疗效果。三叉神经痛治疗需要关注头颅病变，通常由于肿瘤或胆脂瘤以及其它颅内占位性病变导致继发性三叉神经痛。由于治疗较为困难，因此根治性存在一定差别。

原发性三叉神经痛由于病因不明确，因此通常都采用半月神经节射频、伽玛刀治疗以及卵圆孔气囊压迫治疗。这三种治疗方法由于术后都会存在一定副作用，因此患者需要根据自身情况选择。伽玛刀治疗副作用相对较少，患者痛苦较小，但是复发率较高。

微血管减压术受患者年龄、体质限制，因此通常限制老年人选择微血管减压。半月神经节射频手术会产生不同程度面部麻木，但风险较小、创伤较小，治疗相对彻底。