中医认为心内膜炎属于正气虚弱，又外感寒邪，寒邪内舍于心而发病，属于中医温病范畴，可以卫气营血辨证施治。在临床具体治疗往往分几型，比如热毒炽盛、血瘀阻脉的情况，可给予清热解毒、凉血活血治疗，方药常选清营汤合五味消毒饮加减。

针对气阴两虚、热毒内结患者，可给予益气养阴、清热解毒，用生脉饮和解毒济生汤。阴虚火旺者给予滋阴清热，用清毒散再加三黄汤。还有一型是气阴两虚，而血脉瘀滞，可给予益气养阴、活血化瘀，方子可以选用六味地黄汤合补阳还五汤加减。疾病不同阶段，需要根据情况不断辨证调整。