对于低危型患者，可选单一化疗药物进行化疗，高危型患者可选择联合药物化疗。手术治疗主要针对化疗辅助治疗，通常较少使用。
绒毛膜上皮癌的治疗是以化疗为主、手术与放射治疗为辅的综合治疗。根据患者的病史、症状、体征与各项辅助检查结果，判断临床分期，根据临床分期再判断预后、评分，按照评分分为低危型与高危型。6分以下为低危型，6分以上为高危型。再根据患者具体情况，比如患者有无血液系统的疾病，肝肾功能，骨髓对化疗的反应是否敏感，骨髓是否抑制或不能及时增生导致化疗相对延长，以及全身是否有其它的疾病影响化疗等制定合适治疗方案，分层进行治疗。
