化脓性扁桃体的发生一般是在人抵抗力下降的情况下，比如受凉、淋雨、衣服添加少了以及感冒没有积极治疗而从鼻腔往咽部走了等。常见的致病菌是链球菌，会引起扁桃体的化脓、发炎、扁桃体疼痛、发热、颌下淋巴结肿大。

如果扁桃体经常发炎，比如1年超过4次，扁桃体肥大已经引起呼吸、消化、吞咽功能障碍，造成一些皮肤疾病，可以考虑扁桃体切除。