小儿雾化的危害，主要取决于使用的药物不同，危害会不一样。比较常见使用的就是布地奈德类的糖皮质激素类药物，如果长期大量不规范的使用，有可能造成孩子免疫力低下，或者是造成孩子出现真菌感染。

有些孩子在吸入的过程中，可能会造成鼻黏膜或者口腔黏膜出现真菌感染，如出现鹅口疮。所以在孩子做了雾化之后，尽量让孩子擦洗一下脸部，同时适当地进行漱口，避免激素的存留。

另外有一些药物可能要经过肺部进入血液循环，或者进入肾脏和肝脏，有少量的药物要进入血液循环，可能会对机体的肾脏和肝功造成一定的影响。但是多数的情况下，如果正规使用，一般不会造成上述伤害。

还有部分药物，如有些孩子在雾化的时候，使用的β受体激动剂抗胆碱类的药物，也会不同程度的进入血液循环，也有可能会造成机体的肝肾负担。但是如果正规使用，剂量合适，同时使用正规的雾化机器，进入血液循环的剂量非常少，多数是局部作用，能代谢掉，如果正规使用，相对来说副作用比口服要少。