一侧嗓子吞咽疼、耳朵疼的原因如下：

1、咽喉部神经和耳内皮肤感觉神经相连，会出现牵涉痛或放射痛，此时可以判断为咽喉部炎症引起的耳朵痛；

2、少数患者咽喉发炎以后，耳道出现炎症，或者中耳出现炎症，也可出现上述症状，建议患者到耳鼻喉科请医生检查，看鼓膜有没有充血，耳道有没有炎症；

3、感冒时继发性中耳炎，也会出现此类症状，如果有鼓膜充血或耳道炎症，最好配合滴中耳炎的药水治疗，以免简单的耳道炎、鼓膜炎演变成严重中耳炎或出现鼓膜穿孔等并发症。