腔隙性脑梗死比其它类型脑梗死预后好，死亡率和致残率相对较低。发病1年内约70%-80%的腔隙性脑梗死患者，临床症状完全恢复或基本恢复正常，而其它类型的脑梗死患者，仅50%恢复良好。
腔隙性脑梗死，发病30天的病死率不到4%，而其它类型脑梗死约占5%-15%。国外报道腔隙性脑梗死年复发率＜10%，但研究表明，我国的腔隙性脑梗死患者，有相对较高的复发率。因此在明白腔隙性脑梗死对寿命长短影响较低后，我们更加要关注的是如何预防腔隙性脑梗死复发。因为反复发作，引起多发腔隙性脑梗死，可能影响脑功能，出现严重精神障碍、认知功能下降、类帕金森综合征，和尿便失禁等一系列症状。