纵隔肿瘤微创术的疼痛因人而异，另外，手术方式也决定了疼痛的时间。在临床中同样的手术，有的患者会感觉非常痛，但有的患者没有任何感觉。而且发现有的年轻男性对疼痛更敏感。一般微创有两种做法，即在普通胸腔镜下手术和剑突下胸腔镜手术。剑突下的胸腔镜手术切口在上腹部，所以对肋间神经没有影响，而且上腹部神经也比较少，所以术后疼痛非常轻，患者基本没有感觉，术后1-2天就可出院。

但有的胸腔镜手术，如后纵隔神经鞘瘤，要经过肋间做切口，手术中的器械不可避免要压迫到肋间神经，造成神经损伤，术后患者疼痛就比较明显。但也有一些办法来减轻疼痛，如用止痛泵，或者术中进行神经阻滞，即把止痛药物打在神经、肌肉周围，这样患者术后疼痛也会有缓解。但即使经过这些处理，部分患者还是会出现比较剧烈的疼痛。