幼儿发烧40℃的原因，主要包括病毒感染、细菌感染。

1、病毒感染：尤其是秋冬季节，甲型流感病毒、乙型流感病毒高发的时候，幼儿接触到流感病毒之后，可以表现出持续的高热不退，体温可以达到40℃。对于幼儿接触新型冠状病毒，也可以表现为持续的高热不退、头痛、咽痛、肌肉酸痛等症状，体温在39℃。

2、细菌感染：例如肺炎链球菌或者是溶血性链球菌、流感嗜血杆菌等细菌感染引起的扁桃体炎、支气管炎、支气管肺炎等等，细菌感染也可以导致幼儿出现持续的高热不退。

此外，还有支原体和衣原体感染，也可以导致幼儿出现持续高热不退的现象。