部分子宫内膜异位症患者可无任何症状，有症状者主要表现为下腹痛、痛经、不孕、性交不适、月经异常等。治疗目的在于缩减和去除病灶、减轻和控制疼痛、治疗和促进生育、预防和减少复发。治疗方法如下：
　　1、期待治疗：症状轻或者无症状的轻微病变患者可采取期待治疗，如定期复查，并对症处理病变引起的轻微痛经，可服用非甾体类抗炎药如吲哚美辛、双氯芬酸、布洛芬等。但是，因内异症可引起不孕，对于希望生育不孕患者，应尽早使用药物或手术治疗，促使其妊娠，妊娠之后，异位的子宫内膜病灶萎缩，分娩之后症状会有所缓解甚至治愈。
　　2、药物治疗：适用于慢性盆腔痛、经期痛经明显、有生育要求及无卵巢囊肿形成的患者。因非甾体类抗炎药仅能缓解症状，不能阻止病情进展，所以需要使用激素类药物如口服避孕药、孕激素、米非司酮、孕三烯酮、促性腺激素释放激素（LHRH）等控制症状，延缓病情进展，术前、术后辅助使用也可减少手术并发症、防止术后复发。
　　3、手术治疗：对于药物治疗后症状不缓解、局部病变加剧、生育功能未恢复或较大的卵巢内膜异位囊肿患者，则需采取手术治疗，术后还要促性腺激素释放激素（LHRH）用3-6个月，主要预防复发，增加受孕率。目前首选腹腔镜手术，常用的手术方式包括保留生育功能手术、保留卵巢功能手术以及根治性手术等。
　　综上所述，子宫内膜异位症患者若无症状或症状轻，可采取期待治疗；有生育要求的患者可采用药物治疗或手术治疗；药物治疗无效者可采取手术治疗，并在术前、术后辅助用药。