临床上四维彩超检查的最佳时间一般是妊娠20到24周期间，也即在怀孕的第五个月到第六个月期间。

　　胎儿会随着妊娠的进展而逐渐增大，各个组织器官和结构也日趋完善。在孕20到24周期间，处于这一时期的胎儿的各组织器官的解剖结构已经趋于完善，能够为彩超所显示；而且子宫腔内的空间以及羊水量、胎盘的厚度也适合做四维彩超检查。并且在这个时期胎儿骨骼组织对四维彩超的探查影响也相对较小，图像相对比较清晰。此外在这一时期很多胎儿的畸形和异常大部分也都能够表现出来。因此选择在这一时期进行四维彩超检查是最合适的。国家卫生健康委员会也规定在这个时期要筛查出无脑儿、严重脑膨出、单腔心、严重开放性脊柱裂、致死性骨发育不良、严重胸腹壁缺损内脏外翻六大类严重畸形。

　　此外，对于在之前的常规彩超检查中怀疑胎儿存在畸形的受检者，或者胎儿具有罹患畸形的高危因素的受检者，进行四维彩超检查是非常有必要的。而且还需要到有产前诊断资质的医院进行产前诊断。

　　但因母体腹部皮下脂肪比较厚以及羊水过少或胎位等因素的影响，彩超不能很好的显示某些部分的组织结构，所以四维彩超对以上这些畸形的检出率也不是百分之百的。同时彩超也不能检测胎儿的智力，听力，视力以及各组织功能，以及与染色体相关性疾病。甚至对四维彩超检查未见明显异常的胎儿，也有在晚孕期出现畸形的可能。