艾滋病感染后可分为急性期、无症状期和艾滋病期。患者出现腹泻主要可能是在急性期，即感染后1-3周，或者是艾滋病期：
1、急性期：患者感染艾滋病后的1-3周属于艾滋病急性期，这一时期患者会出现类似流感的一系列症状，如腹泻、恶心、呕吐、头晕、关节痛等。但是急性期通常时间不会太长，一般持续10天左右，症状会逐渐自行消退；
2、艾滋病期：在患者度过艾滋病的急性期后，会先进入无症状期，再进入艾滋病期。无症状期时间较长，可能会持续10-20年，而此期的患者无明显异常症状。因此当艾滋病患者再次出现腹泻时，多已是艾滋病期。这一时期的患者可能会出现发热、腹泻、体重下降、全身浅表淋巴结肿大，常合并各种条件性感染，例如口腔念珠菌感染、肺炎、巨细胞病毒感染、疱疹病毒感染、弓形虫感染、隐球菌脑膜炎及活动性肺结核等，以及肿瘤，例如卡波西肉瘤、淋巴瘤等。这一时期的患者免疫系统已经遭到破坏，常常会出现肿瘤引起的腹泻，可能会伴有腹部不适、疼痛等症状，应注意鉴别。
