腱鞘囊肿少数可以自愈，大部分需要针对性治疗才能治愈。腱鞘囊肿大多是由于局部关节长期反复劳损导致的劳损性疾病，早期患者经过休息以及局部制动，有些可以慢慢吸收而达到自愈标准。如果囊肿程度比较轻，可以进行局部热敷以及按摩，促进局部血液循环，促进囊肿的吸收。

也有可能局部受到暴力撞击，囊肿破裂，局部休息制动配合热敷，机体慢慢吸收。囊肿壁与周围组织粘连，囊肿完全消失。腱鞘囊肿自愈可能性在10%左右，如果腱鞘囊肿发生后局部仍然反复屈伸活动，囊肿会进一步增大对周围造成压迫，引起明显的肿胀、疼痛等。大部分需要经过治疗，主要包括针刺、穿刺以及手术治疗。