男科疾病的治疗包括了心理治疗、药物治疗以及手术治疗等，不同的疾病采用的治疗方法有所不同。有的疾病可能需要采用多种治疗联合的方法，男科疾病主要包括了男性不育症、前列腺疾病、性功能障碍以及男性其他疾病，大部分的疾病的治疗以药物治疗为主，对于伴有精神心理疾病或焦虑抑郁状态的，则需要结合心理治疗。

对于男性肿瘤性疾病、精索静脉曲张、生殖器畸形等疾病，则多数要通过手术治疗。另外，手术后可以辅助药物治疗以巩固疗效。