治疗肛乳头肥大没有特效药。肛乳头肥大，可见于慢性肛裂、肛窦炎等疾病。肛乳头肥大的原因主要是由于慢性的炎症刺激，导致肛柱下端和肛门瓣出现水肿，因外形像乳头，故称为肛乳头肥大。

治疗肛乳头肥大，主要是治疗原发疾病。如果是慢性肛裂导致的，可以使用高锰酸钾稀释液温水坐浴，改善局部微循环；局部肛门使用肛泰栓，消肿止痛；口服抗生素，左氧氟沙星预防感染；口服迈之灵片改善微循环，减轻水肿；口服缓泻剂，保持大便通畅。避免辛辣刺激性食物的摄入，多饮水，忌烟忌酒。

如果经过保守治疗效果不佳，可以考虑手术治疗。