化脓性中耳炎的治疗分为急性期和慢性期。在急性期，也即初次发作化脓性中耳炎的时候，治疗以抗炎为主，口服或静脉注射抗生素，一般首选青霉素类或头孢类的抗生素，然后外用耳道内的滴耳液治疗。当然在进行外用的滴耳液之前，首先要清理掉外耳道里边的脓性的分泌物，保持外耳道的清洁状态下再进行滴药才可以发挥相应的作用。

急性期的中耳炎治疗以后如果反复发作转为慢性化脓性中耳炎，慢性化脓性中耳炎在急性发作的时候也是进行相关的治疗。但是如果持续的流脓，这种情况下就要首先进行中耳乳突CT的检查，检查否存在中耳及乳突内有肉芽病变或是否合并了息肉或胆脂瘤。如果是有肉芽、胆脂瘤或息肉等形成的话，就要考虑相关的手术治疗。如果说没有这种情况，只是单纯的流脓症状，治疗方法还是口服抗生素或加滴耳液，同时可以进行相关的外耳道的局部照射治疗进行相关的理疗。

如果说在化脓性中耳炎的静止期即没有在流脓感染的情况下，就要避免耳道内的进水，然后同时要进行全身状况的调理。如果存在鼓膜穿孔的情况下，在化脓性中耳炎的静止期可以考虑做手术进行鼓膜穿孔的修补。