肛瘘手术后如果有月经，首先需要停用止血药物，避免由于止血药物的作用而导致月经量减少或者消失，从而打乱月经周期，使得月经不规律或者内分泌紊乱。

其次由于月经期间阴道经血或者分泌物较多，所以需要及时的更换卫生巾或者卫生纸，尤其是局部按压到肛瘘伤口的，一定要保证局部伤口的通风和通畅，避免由于卫生巾的不透气而导致伤口的感染。如果是已婚或者已产妇女，建议使用卫生棉条，避免局部伤口包裹而使得通风不畅，加重感染的可能性。

每次换药前或者排便后，建议对肛门局部进行清洗，也可以另外选择容器和水对阴道进行清洗，一定不能相互清洗，避免交叉感染。月经期间一定要勤换卫生巾或者勤换药，这样可以减少经血停留于伤口处而引起其他的刺激性症状。