甲状腺功能减退症有不同原因，对于一般甲减，提倡终身服药，因为一般甲减由于缺乏甲状腺激素造成，需要补充充足的甲状腺激素，才能使其甲状腺功能恢复。不需要终身服药的患者，临床上常表现为亚甲炎，亚甲炎病人出现甲状腺早期功能亢进，后期表现甲状腺功能减退，但是一般亚甲炎可自行恢复，不需要补充甲状腺激素。

但是极个别人会出现较长一段时间的甲状腺功能减退，需要补充适量甲状腺激素。妊娠合并有甲状腺机能减退，或者亚临床甲状腺功能减退患者，需要短期之内补充甲状腺激素，改善其甲状腺功能。对于一般甲状腺功能减退患者，需要终身服用甲状腺激素治疗，维持正常的甲状腺功能。