肺炎球菌是引发中耳炎、肺炎、脑膜炎的主要病因，13价肺炎疫苗主要用于预防肺炎球菌感染所导致的肺部疾病。
儿童和免疫力低下的老年人是肺炎球菌的易感人群，为了预防肺炎疾病，需要接种13价肺炎疫苗。免疫力低下的老年人通常指65岁以上老人，免疫功能正常，但是患有慢性疾病，比如心血管病、肺病、糖尿病、肝硬化等。免疫功能减弱者主要包括在感染肺炎球菌或出现其并发症的高危环境中群居的人和工作人员，比如长期住院的老年人、福利机构人员等，慢性肾衰、肾病综合征、脑脊液漏患者，无症状和症状性艾滋病病毒感染者，以及脾切除或脾功能不全、镰状细胞病、霍奇金病、淋巴瘤和器官移植病人。
但是需要注意的是13价肺炎疫苗用于预防肺炎球菌血清型，包括1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19A、19F和23F引起的感染性疾病，对肺炎球菌其他亚型和其他细菌感染引起的肺炎无效。
