反流性食管炎治疗用药主要是减轻反流和减少胃黏膜的刺激，减轻胃反流主要应用促进食管和胃排空的药物，临床上常用的包括胃复安、多潘立酮、西沙比利等，这类药物能够促进食管、胃的排空，从而减轻胃食管反流。

降低胃酸的药物主要包括中和胃酸和抑制胃酸分泌两方面，其中中和胃酸的药物包括氢氧化铝凝胶、氧化酶等，从而减少酸性胃内容物对食管黏膜的损伤。抑制胃酸分泌的药物有法莫替丁、甲氰米胍及质子泵抑制剂，比如奥美拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑等。