单疱脑炎临床上比较常见，患者严重时可能会出现意识障碍，包括昏迷状态、去大脑皮质状态和植物状态。患者也可能会引起痴呆，也可能会出现精神症状和癫痫发作等各种表现。

如果患者是单纯脑炎，轻症时主要表现为头痛、恶心、呕吐、发热，也可以出现肢体感觉障碍或者运动功能障碍，包括肢体麻木、痛，也可以出现肢体无力或者一侧肢体瘫痪等，患者也可能会出现语言障碍，可以表现为构音障碍或者失语，也可以出现偏盲象限盲，有些患者也可能会出现失明。如果脑炎病变侵犯到脑干和小脑可以出现头晕，也可能会出现平衡障碍、吞咽困难、饮水呛咳等。