怀孕后检查出卵巢囊肿，应在医生指导下明确卵巢囊肿严重程度，了解对胎儿的生长发育有无不良影响后，遵医嘱进行相应处理。
如果为生理性的卵巢黄体囊肿或囊肿体积较小，且无增长趋势，孕妇没有腹痛、发热、阴道异常流血等不适症状，一般无需特殊治疗，遵医嘱定期进行B超检查，关注卵巢囊肿变化即可。
若囊肿的最大径＞5cm，可以在怀孕14-16周后，遵医嘱进行囊肿剥除术，术后进行保胎治疗，如口服黄体酮胶囊、固肾安胎丸、孕康口服液等药物。
若囊肿在短期内有明显的增长，或出现腹痛、出血等先兆流产症状，考虑卵巢囊肿破裂、蒂扭转或为恶性病变，需要完善肿瘤标志物五项检测、B超检查等，在医生综合评估下明确病情，必要时进行手术治疗清除病灶，还需将切除的组织送病理检查，进一步明确疾病性质。
孕期发现卵巢囊肿后，孕妇应保持稳定的情绪，避免出现过度焦虑、抑郁等不良情绪，以免影响胎儿发育。还应遵医嘱定期孕检，出现不适症状后及时告知医生，避免出现先兆流产的情况。
