治疗脑血栓后遗症的药物有很多，主要有以下几方面：

1、预防脑血栓再复发的药物，常用的有抗血小板聚集治疗如阿司匹林或硫酸氢氯吡格雷，防止患者再发生血栓的问题。

2、针对基础疾病进行用药，要严格降压、降糖、降脂治疗，要服用阿托伐他汀钙片或瑞舒伐他汀钙片，降脂、稳斑、保护血管内皮。

3、针对患者后遗症使用具有活血化瘀、促进脑神经功能恢复、改善脑代谢的药物。临床上常用的包括蛭蛇通络胶囊、复方地龙胶囊、银杏酮酯滴丸、血塞通片、脉血康类，还有改善脑代谢的胞磷胆碱钠片、奥拉西坦胶囊、脑蛋白水解物片。