男性在性交后，出现阴茎疼痛的原因，主要有以下几种：

1、润滑不足：性交前准备不充足，前戏不够，导致女方阴道分泌液不足，便会出现阴茎摩擦困难、疼痛，甚至外伤；

2、性生活过频：频繁性生活会导致输精管、精囊、尿道等器官经常性充血、水肿，射精时平滑肌收缩，便会造成疼痛；

3、疾病因素：有生殖系统及泌尿系统感染，如尿道炎、膀胱炎、前列腺炎、精囊炎、附睾炎等时，射精时会使肌肉收缩对炎症病灶挤压，便会引起疼痛。

建议性交前充分前戏，待女方阴道湿润后再插入，保持阴部清洁，避免性生活过于频繁。如果性交后疼痛仍无法缓解，建议尽早到正规医院男科或泌尿外科就诊检查，明确病因，对症治疗。