怀孕和胃肠炎症都有可能会引起恶心、呕吐、厌食的症状，怀孕所引起的恶心、呕吐、厌食绝大部分是在早晨相对症状比较严重，而胃肠炎引起的胃肠道反应无论在什么时候都可能会出现。另外，怀孕会有明显的停经史，而胃肠炎症不一定有停经史，胃肠炎症会出现下腹部、胃部不舒服或者出现疼痛，而正常的怀孕不会出现疼痛。

通过抽血检查或者尿液HCG的化验，可以做出相应的鉴别诊断，怀孕以后尿HCG会呈现阳性反应，而胃肠炎症通过尿HCG化验不会出现阳性反应，胃肠炎症通过大便常规化验可能会出现阳性结果。