幼儿川崎病复查的项目常见的包括血常规、尿常规、肝肾功能。另外还需要监测心电图以及心脏彩超，尤其是在早期出现心脏受累的患儿，更需要定期的复查心脏彩超，了解有没有瓣膜以及大血管的损伤。

多数幼儿川崎病在早期及时治疗，不会遗留后遗症。但有一部分患儿由于疾病比较重或者延误了治疗，或者对药物治疗效果比较差，而导致了心功能异常或者是动脉狭窄。