婴幼儿肠炎的症状主要表现为腹泻、腹痛、呕吐等，婴幼儿时期身体免疫力、肠道功能对外界抵抗力差，稍不注意就会引起肠炎。

由于细菌、病毒、肠黏膜炎症受到刺激时肠内容物增多，幼儿肠动力增强，吸收功能降低时会引起腹泻，肠炎会引起肠管内致病菌大量滋生导致肠黏膜细胞坏死、脱落、充血，引起肠管痉挛时会表现为腹部疼痛，由于细菌会产生各种毒素引起肠管内血管、支配神经出现中毒样改变，肠功能紊乱时也会引起疼痛。

由于肠黏膜部位的炎症刺激消化道感受器传入延髓的呕吐中枢引起兴奋，通过传输神经达到胃、呼吸肌、咽、会厌就会引起幼儿呕吐。