灰指甲是由真菌感染引起的，对于真菌感染引起的皮肤疾病，其病程较长、容易复发，治疗原则是彻底的杀灭真菌，防止真菌传染。对于灰指甲的治疗，基本上是采用一般治疗和药物处理两种。

一般治疗包括对患处进行局部的清洁处理、保持干燥，同时在饮食上要进行控制，要清淡的饮食，避免酸辣刺激性的食物。同时避免对灰指甲局部进行搔刮、按摩等动作，以避免真菌的传染。

药物上面可以在局部应用酮康唑、益康唑等乳膏，进行涂抹抗真菌处理，也可口服抗真菌的药物，如伊曲康唑、灰黄霉素等治疗。另外，如果灰指甲伴发有细菌感染，在患处还必须应用硼酸溶液进行湿敷消炎等治疗。