因为蒙脱石散只在肠道局部起作用，不吸收进入到全身，因而不良反应比较轻，偶见便秘、大便干结。

如果出现便秘，可减少剂量继续服用。治疗急性腹泻时，应注意纠正脱水。对该药过敏者要禁用，过敏体质患者要慎用。蒙脱石因具有层纹状的结构，以及非均匀性的电荷分布，因此对消化道内的病毒、细菌及其产生的毒素，有固定和抑制的作用，对消化道黏膜有覆盖能力。并通过与黏液糖蛋白相互结合，从质和量两个方面来修复，提高黏膜屏障对攻击因子的防御功能。临床主要用于急、慢性腹泻的治疗，如果是感染性的腹泻，可合并抗生素。另外，也可以用于食道、胃、十二指肠疾病引起的相关疼痛症状的辅助治疗。但该药不能作为解痉剂使用，不具有解痉的作用，因而对痉挛性的疼痛效果不好。

除此之外，蒙脱石散还具有抗幽门螺杆菌的作用，因为该药是在肠道局部吸收起作用，会在肠道黏膜上形成一个保护膜，因此如果需要服用其他药物时，建议与该药间隔一段时间服用，以免蒙脱石影响其他药物的吸收。