化脓性扁桃体炎，既可以是细菌感染引起，也可以是病毒感染引起。
乙型溶血性链球菌是化脓性扁桃体炎的主要致病菌，非溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎链球菌、流感杆菌、腺病毒、B病毒、单纯性疱疹病毒等也可引起化脓性扁桃体炎，同时，细菌或病毒混合感染者也不少见，近年来还发现有厌氧菌感染者，革兰氏阴性杆菌感染者有上升的趋势。
正常人咽部及扁桃体隐窝内，留存着某种病原体。当人体抵抗力降低时，病原体大量繁殖，多数破坏隐窝上皮，细菌侵入其实质而发生炎症，当患者受凉潮湿，过度劳累烟酒过度，有害气体刺激上呼吸道有慢性病灶存在等，均可诱发本病。
化脓性扁桃体炎的病原体，可以通过飞沫或者直接接触而传染，要想区别是细菌性还是病毒感染，建议到医院做血常规检查。如果血象比较高说明是细菌感染引起，如果血象不高，说明是病毒感染引起的。
