男性不育症的病因主要包括精液异常、生精障碍、输精管梗阻、全身性因素、不明原因等。
1、精液异常：大多数男性不育是因为精液中精子异常导致。无精子或精子过少，精液中精子密度低于1500万/ml时则造成不育，这种不育可分为永久性、暂时性。少精、弱精症、死精症、无精症等都很常见，发现要及早诊断治疗。
2、生精障碍：是男性不育症原因之一。男性睾丸本身患有疾病，如染色体异常，精子发生障碍，还包括局部病变，如精索静脉曲张、睾丸附睾炎症、睾丸巨大鞘膜积液等疾病，影响了睾丸局部的外环境或因温度、压迫等原因，造成不育。
3、输精管梗阻：一些男性出现不育，是因为输精管梗阻引起。输精管不通畅会使精子和卵子无法正常结合，影响受精卵形成，进而造成不育症。
4、全身性因素：身体患有其它疾病，也会引起男性不育。如生活环境突然改变，导致长期精神紧张；进行高空、高温、超强度劳作、及从事放射线工作，营养因素、内分泌疾病等。
5、不明原因：诸多男性患者经详细检查后，仍未能查出相关病因，称之为特发性不育症。
