引发生殖器溃疡的病因较多，其中最常见主要是由梅毒螺旋体、单纯疱疹病毒等感染引起。此外，外伤、白塞病等也可引起溃疡发生。
一、疾病因素：
1、硬下疳：感染梅毒后7～60天出现，大多数病人硬下疳为单发、无痛无痒、圆形或椭圆形、边界清晰的溃疡，高出皮面，疮面较清洁，有继发感染者分泌物多。触之有软骨样硬度。持续时间为4～6周，可自愈。硬下疳可以和二期梅毒并存。
2、白塞病：白塞病又叫做贝赫切特病，通常表现为反复口腔溃疡、外阴溃疡、眼炎等，多为慢性疾病，在免疫系统疾病中，属血管炎范畴，除出现反复口腔溃疡、外阴溃疡外，可累及人体多个器官，如关节肌肉、眼睛、血管、心脏、肺和神经系统等。
3、生殖器疱疹：外生殖器或肛门周围有群簇或散在的小水疱，2~4天后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛，可伴有出现发热、头痛、乏力等全身症状。
4、软下疳：患者感染杜克雷嗜血杆菌之后可以出现软下疳，继而可引起生殖器溃疡。
二、非疾病因素：
外伤或摩擦可以导致生殖器溃疡。
