口腔疱疹可分为口腔单纯性疱疹、口腔带状疱疹、手足口病，病因有所不同。

1、口腔单纯性疱疹

（1）病毒感染：口腔单纯疱疹病毒感染90%以上为Ⅰ型单纯疱疹病毒感染（HSV），也有少数为Ⅱ型。

（2）复发感染：人接触HSV后逐渐产生抗体，由于抗体产生不足，如再有外界刺激因素存在，全身免疫功能发生改变，引起复发感染。

2、口腔带状疱疹

水痘-带状疱疹病毒可通过唾液飞沫或皮肤接触而进入人体，经过皮肤粘膜进入血管，或侵犯神经末梢，以后潜伏于脊髓神经的后结节或脑神经髓外节、三叉神经节，病毒被激活后则引起带状疱疹。

3、手足口病

主要是由柯萨奇A16型病毒和肠道病毒71型引起的感染，亦可由柯萨奇A5、A10、B5、B2等所致。