消化管壁的一般结构是由四部分组成，即黏膜、黏膜下层、肌层以及外膜所构成，具体如下：

一、黏膜

由上皮、固有层和黏膜肌层组成，是消化管各段结构差异最大、功能最重要的部分。

1、上皮：上皮的类型依部位而异。消化管的两端（口腔、咽、食管及肛门）为复层扁平上皮，以保护功能为主；余为单层柱状上皮．以消化吸收功能为主。上皮与管壁内的腺体相连续。上皮细胞间隙有散在分布的淋巴细胞．尤以在小肠上皮中多见。

2、固有层：为疏松结缔组织，细胞成分较多，纤维较细密，有丰富的毛细血管和毛细淋巴管。胃肠固有层内富含腺体和淋巴组织。

3、黏膜肌层：为薄层平滑肌，其收缩可促进固有层内的腺体分泌物排出和血液运行，利于物质吸收和转运。

二、黏膜下层

黏膜下层为较致密的结缔组织，含小动脉、小静脉与淋巴管。在食管及十二指肠的黏膜下层内分别有食管腺和十二指肠腺。黏膜下层中还有黏膜下神经丛，由多极神经元与无髓神经纤维构成，可调节黏膜肌的收缩和腺体分泌。在食管、胃小肠和大肠，黏膜与黏膜下层共同向管腔面突起，形成皱襞，具有扩大黏膜表面积的作用。

三、肌层

除食管上段与肛门处的肌层为骨骼肌外，余大部分为平滑肌。肌层一般分为内行、外纵行两层，胃的肌层较厚，分为内斜、中环和外纵三层。

肌层间有肌间神经丛，结构与黏膜下经丛相似，调节肌层的运动。

在肌间的结缔组织中有间质卡哈尔细胞，多突起状，核椭圆形，胞质较少，含较多线粒体。此细胞在HE染色的标本中不易辨认间质卡哈尔细胞可产生电信号，通过缝隙连接传递给平滑肌细胞，起肌层自发缓慢的节律性收缩。

四、外膜

消化管壁的最外层为外膜，按其组成的不同可分为浆膜与纤维膜两种。

消化管上段(咽和食管)及下段(直肠)的外膜由疏松结缔组织组成，称纤维膜，与周围的组织相连。

消化管中段，包括胃和肠的最外层，除薄层结缔组织外还有间皮覆盖，称浆膜，可保持胃肠外表面光滑，减少摩擦，有利于胃肠蠕动。