克罗恩病缺乏诊断的金标准，需要结合临床表现、内镜检查、组织病理学检查，还有影像学检查进行综合判断。

1、临床表现：如果出现了腹痛、腹泻，体重减轻持续6周以上，要高度怀疑克罗恩病，其临床症状包括慢性反复发作的右下腹或脐周疼痛，伴有明显的体重减轻、生长发育迟缓等情况，部分患儿也可以有口腔溃疡。

2、内镜检查：内镜下的胃肠道的病变是节段性、非对称性，是跳跃性分布，溃疡主要是阿弗他溃疡，还有裂隙样溃疡等。

3、组织病理学检查：病理可以表现为，全层的肠壁淋巴细胞增生、非干酪样肉芽肿等等情况。

4、影像学检查：主要是包括磁共振小肠成像，或者CT小肠成像，可发现肠道的炎症范围以及破坏的程度等。